Najczęstszą przyczyną biegunek u źrebiąt są zakażenia bakteriami typu: Salmonella, Clostidium, E coli, Rhodococcus equi i zarażenia wirusowe typu : rotawirusy, inwazje węgorków w stajniach silnie zarażonych tymi pasożytami a także pierwotniaki. Biegunki często dotykają źrebiąt które nie nabyły odporności z siarą. Najczęściej spotykaną biegunką jest tzw. biegunka rujowa która pojawia się u kilkudniowych źrebiąt. Uważa się że spowodowana ona jest rozpoczęciem pobierania pasz stałych przez noworodka a także intensywnym interesowaniem się otoczeniem (lizanie i jedzenie wszystkiego co znajduje się w zasięgu wzroku źrebaka) U niektórych źrebiąt może wystąpić biegunka spowodowana przekarmieniem gdy klacz wydziela nadmierną ilość mleka.
Objawy biegunek:
Lżejsze biegunki, gdzie jedynym objawem jest rzadki kał wymagają zwykle dokładnej obserwacji, przy cięższych biegunkach występuje dodatkowo osowienie, apatia, niechęć do ssania,, błony śluzowe stają się suche, widoczne jest także zapadnięcie gałek ocznych oraz odwodnienie.
Biegunki leczy się terapią płynową, ważne jest odpowiednie nawodnienie oraz dostarczenie utraconych elektrolitów. W cięższych przypadkach niezbędne będzie również podanie antybiotyków. Aby zapobiegać biegunkom u źrebiąt należy dbać o to by nabyłyone naturalną odporność i wypiły jak najszybciej siarę matki. Należy również dbać o higienę w boksach w których źrebią się klacze, często je czyścić i starać się regularnie wymieniać ściółkę.