Comtois podobnie jak większość francuskich koni jest głównie koniem rzeźnym, ale często użytkuje się go również przy upawie winorośli i w leśnictwie. Historia powstania tej rasy sięga aż VI wieku, kiedy to w okresie wędrówek ludów Burgundowie przemieszczali się się na zachód z ciężkimi germańskimi końmi roboczymi. Przez pewien czas ten łagodny olbrzym, pełnił również funckję konia rycerskiego, Ludwik XIV i Napoleon dysponowali całymi oddziałami kawalerii i artylerii, które używały tej rasy.. Comtois do 1554 r był używany także do ulepszania starej rasy bourguignon. Obecnie główny obszar hodowli tych koni znajduje się w górzystych regionach przygranicznych między Francją a Szwajcarią. Na tych terenach comtois wykształcił wytrwałość i pewność chodów.