Ponieważ jest bardzo podobny do konia huculskiego, uznaje się że kuc bośniacki pochodzi od tych samych przodków. Być może znajdują się wśród nich także hodowane w antycznej Grecji konie tesalskie. W budowie widoczna jest domieszka krwi orientalnej za pośrednictwem koni tureckich.Dolew krwi arabskiej spowodował wykształcenie zbyt słabych i lekkich kończyn dla konia użytkowanego głównie pod wierzch i w rolnictwie.